העמותה תרמה לבית הספר היסודי שבו למד נתן במודיעין, תרומה מכובדת ביותר לרכישת משחקים ואביזרים לחדר שנקרא "החדר של נתן". אחת הכיתות שופצה לחדר צבעוני, המעוצב באופן שונה משאר הכיתות. החדר הוקם עם המון תשומת לב ואהבה ובו משחקים, ספרים, וחומרי יצירה. החדר הפך למקום חמים שהאווירה בו נעימה ומרגיעה, העונה על הצורך של ילדים המתקשים לפעול לאורך כל היום בלמידה פורמאלית וזקוקים להפוגה במהלך יום הלימודים.
הוא מזמן לילדים מגוון פעילויות חווייתיות ומהנות מעולמם, ומאפשר להם הפוגה זמנית מהלמידה הפורמלית.
מטרתו לסייע לתלמידים לשפר את יכולת ההתמודדות, לשפר את תחושת המסוגלות העצמית תוך חיזוק היחס האישי, מתן תמיכה ויצירת שיח מעצים עם התלמידים .
בחדר התלמידים יזכו לקשר אחר עם המורים ולדיאלוג משמעותי שונה מזה המתקיים בכיתת הלימוד.
מספר בתי ספר פנו לעמותת "אור נתן" בבקשה לסייע להם להקים במתחם בית הספר כיתה שתקרא "החדר של נתן".
